НИИ неотложной детской хирургии и травматологии выступает организатором и соорганизатором нескольких десятков научных мероприятий по разным тематикам. Флагманским мероприятием, безусловно, является научно-практическая конференция «Неотложная детская хирургия и травматология», которая традиционно проводится в рамках конгресса педиатров России «Актуальные проблемы педиатрии». Ежегодно ее посещает более тысячи участников из России и ближнего зарубежья – Беларуси, Украины, Казахстана, Узбекистана и других стран постсоветского пространства. Конференцию по праву можно называть одним из важнейших событий в научной жизни детских хирургов бывшего СССР. 

Набирают популярность и специализированные выездные школы-семинары НИИ НДХиТ. В прошлом году подобное мероприятие впервые прошло в другой стране, Республике Молдова, при поддержке Министерства здравоохранения, труда и социальной защиты. В России школы, посвященные детской хирургии, нейрохирургии, травматологии, реабилитации, а также смешанные школы проводятся в Санкт-Петербурге, Нальчике, Воронеже, Грозном. География расширяется ежегодно. 

Научные мероприятия НИИ неотложной детской хирургии, объединенные одним общим названием Школа НИИ НДХиТ, призваны стать площадкой для обмена опытом и лучшими практиками между профессионалами, для получения новых знаний, для развития, в конечном счете – для достижения высокого уровня качества и эффективности оказания медицинской помощи детям. Этому способствует мощная образовательная программа, включающая не только лекции и доклады экспертов, но и дискуссионные панели, практические семинары с отработкой навыков на учебных моделях и фантомах.